Muestra resistencia cruzada con la lincomicina y efecto antagónico in vitro con eritromicina. Debido a la limitada biodisponibilidad sistémica del miconazol después de la administración vaginal, es poco probable que ocurran interacciones con relevancia clínica. Sin embargo, en pacientes tratados con anticoagulantes orales, como la warfarina, se debe tomar precauciones y deben vigilarse los efectos anticoagulantes.