Los comprimidos recubiertos biconvexos de Helicobax son bien tolerados. Los efectos adversos incluyen nauseas, vómitos, diarrea, y dolor abdominal. Otros efectos adversos ocasionales incluyen dolor de cabeza, rash cutáneo, sabor metálico (cambio en el sabor), glositis, estomatitis, urticaria, erupciones y leucopenia moderada.